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研究发现多个癌症体细胞突变

  研究发现多种癌症体细胞突变

  来自Genentech,Affymetrix和宾州州立大学的研究人员已经使用错配修复检测和互补方法,在7月28日在线发表了自然界中几个人类癌症的体细胞突变。研究人员收集了大约1,500个编码数百个乳腺癌,肺癌,卵巢癌,前列腺癌和胰腺癌的基因,发现近2600个体细胞突变,其中包括2400多个以前没有报道过的突变。正如预期的那样,突变频率和突变频率随着肿瘤类型而变化,尽管多个受影响的基因常常落入肿瘤相关途径中。
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Genentech公司的分子生物学专家和文章的作者Somasekar Seshagiri及其同事使用错配修复检测和Affymetrix的平铺阵列技术检测441个肿瘤中约400万个DNA基因中的体细胞突变包括183个乳腺肿瘤,134个肺肿瘤,58个卵巢肿瘤,58个前列腺肿瘤和8个胰腺肿瘤。
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错配修复检测技术由Affymetrix研究员Malek Faham开发,并于2007年在Nature Methods上发表。它使用大肠杆菌甲基化指导的DNA修复机制来发现DNA样本和常见等位基因之间的错配。根据突变的存在或不存在,细菌改变抗生素抗性。
\\ u0026>这一次,研究人员专注于可能在癌症或相关过程中发挥作用的基因,分析1507个基因的编码外显子和相邻剪接位点。总体而言,该研究小组发现了2,576个体细胞突变,影响了967个基因。其中,95%的突变是新的,并且在过去的癌症研究中没有被报道或不在数据库中。在频繁突变的基因中,研究人员测试了许多蛋白激酶基因和编码G蛋白偶联受体的基因。虽然突变经常发生,但是突变的频率和性质通常随肿瘤类型而变化,表明致癌作用的遗传机制的复杂性。同时,研究组统计分析发现,在所检测的肿瘤类型中,有77个基因发生突变的可能性更大,其中包括19个肺鳞状细胞癌和18个肺腺癌A基因,当他们使用Roche 454测序来观察一些的新发现的50个额外肺癌突变中,该研究组发现这些样本中某些相同基因的突变频率相当。研究人员还使用了安捷伦的244K芯片比较基因组杂交在大多数样品中,将数据与突变信息相结合以减少潜在的肿瘤抑制剂或致癌基因。 Seshagiri解释说:“如果这些基因被扩增和突变,它们很可能是致癌基因,如果它们缺失,它们可能是肿瘤抑制基因。
在他们的后续实验中,研究小组针对G蛋白偶联受体途径GNAO1和JNK信号通路MAP2K4研究了这些基因突变对细胞系的影响。
\\ u0026>研究小组还在研究更多的癌症样本和亚型,并继续撰写癌症相关的体细胞突变目录。通过鉴定这些突变,他们希望更多地了解与特定癌症亚型相关的生物学变化,并揭示癌症治疗的候选途径。 (来源:生物通光明)点击

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