快捷搜索:

基因组所完成鲤鱼基因组初步测定分析

  基因组完整鲤鱼基因组的初步分析

  近日,中国科学院北京基因组研究所利用新一代高通量测序技术和高性能生物信息学分析,完成了鲤鱼基因组的初步测定和分析,获得了高度覆盖的鲤鱼基因组数据。 “鲤鱼基因组计划”是基因组学与水产基因组研究中心和黑龙江省水产研究所的联合研究项目。目前该项目进展顺利。这是中国第一个鱼类全基因组测序项目,也是世界上第一条鲤鱼经济鱼类基因组计划。该项目主要依托基因组基因组和生物信息学平台第二代高通量测序仪进行测序分析。该平台拥有13台新一代高通量测序仪(SOLiD,Solexa和454 Sequencing Instrument),3台3730xl,1台3130xl的测序规模,计算能力超过10 teraflops,存储容量超过1000TB。目前,已经对454个目录库进行了测序,总体数据覆盖了4次,完成了一些转录组的工作,为基因组注释提供了参考。目前,该项目正在加紧进行生物信息学分析,预计鲤鱼基因组框架图将比计划提前完成。科学家希望通过鲤鱼基因组测序和序列分析,提供有关养殖鱼类生长,发育,繁殖,遗传变异,疾病和环境(包括复原力)与其遗传改良之间相互作用的信息。通过鲤鱼遗传学研究,可以得到与经济性状相关的基因,疾病和免疫相关基因,为鲤鱼遗传育种提供依据。随着人类和其他主要动植物的基因组的破译,模型动物和经济动物的基因组学已处于优势地位,越来越多的鱼被列入议事日程,来自世界各地的科学家完成了一些跟踪鱼类基因组测序和分析主要是在该地区或国家的鱼产品,如在日本完成的鲶鱼,在挪威和加拿大完成的大西洋鲑鱼等。作为中国分布最广,品种最多,产量最高的鲤鱼基因组项目,是我国水产养殖研究走向先进科学的一个里程碑事件,将对我国水产养殖业发展产生重要影响。中国和世界。
 

您可能还会对下面的文章感兴趣: